开放靶点搜索Skill open-targets-search

这个技能是一个基于AI的语义搜索工具,允许用户通过自然语言查询搜索Open Targets数据库中的药物-疾病关联和目标验证数据,适用于目标验证、药物重定位、遗传证据分析等生物信息学应用。关键词:开放靶点、语义搜索、药物靶点、疾病关联、精准医学。

NLP 0 次安装 0 次浏览 更新于 3/18/2026

name: open-targets-search description: 使用自然语言查询搜索Open Targets药物-疾病关联和目标验证数据。目标验证由Valyu语义搜索提供支持。 keywords:

  • 开放靶点
  • 药物靶点
  • 目标验证
  • 疾病关联
  • 精准医学
  • 语义搜索 license: MIT

Open Targets搜索

使用Valyu语义搜索API的自然语言查询,搜索完整的Open Targets药物-疾病关联和目标验证数据库。

为什么这个技能强大

  • 无需API参数解析:直接传递自然语言查询,无需构建复杂搜索参数
  • 语义搜索:理解查询含义,不仅仅是关键词匹配
  • 全文本访问:返回完整的目标-疾病关联数据,包括证据评分
  • 图像链接:包含可用的数据可视化
  • 全面覆盖:访问所有Open Targets药物-疾病关联数据

要求

  1. Node.js 18+(使用内置fetch)
  2. Valyu API密钥,从 https://platform.valyu.ai 获取(10美元免费额度)

关键:脚本路径解析

本文档中的 scripts/search 命令相对于此技能的安装目录。

运行任何命令前,使用以下命令定位脚本:

OPEN_TARGETS_SCRIPT=$(find ~/.claude/plugins/cache -name "search" -path "*/open-targets-search/*/scripts/*" -type f 2>/dev/null | head -1)

然后对所有命令使用完整路径:

$OPEN_TARGETS_SCRIPT "JAK2抑制剂" 15

API密钥设置流程

当运行搜索并收到 "setup_required": true 时,遵循此流程:

  1. 向用户询问API密钥: “为了搜索Open Targets,我需要您的Valyu API密钥。在 https://platform.valyu.ai 获取一个免费的(10美元额度)”

  2. 用户提供密钥后,运行

    scripts/search setup <api-key>
    
  3. 重试原始搜索。

何时使用此技能

  • 疾病的目标验证
  • 药物-疾病关联
  • 研究目标优先级排序
  • 目标的遗传证据
  • 目标-疾病通路分析
  • 治疗假设验证

输出格式

{
  "success": true,
  "type": "open_targets_search",
  "query": "JAK2抑制剂",
  "result_count": 10,
  "results": [
    {
      "title": "目标-疾病关联",
      "url": "https://platform.opentargets.org/...",
      "content": "关联数据、证据、评分...",
      "source": "open-targets",
      "relevance_score": 0.95,
      "images": ["https://example.com/pathway.png"]
    }
  ],
  "cost": 0.025
}

处理结果

使用jq

# 获取关联标题
scripts/search "查询" 10 | jq -r '.results[].title'

# 获取URL
scripts/search "查询" 10 | jq -r '.results[].url'

# 提取完整内容
scripts/search "查询" 10 | jq -r '.results[].content'

常见用例

目标验证

# 查找目标证据
scripts/search "炎症性疾病中的激酶目标" 50

药物重定位

# 搜索重定位机会
scripts/search "靶向IL-6通路的药物" 20

遗传证据

# 查找遗传关联
scripts/search "功能丧失变异保护效应" 15

疾病机制

# 搜索机制洞察
scripts/search "癌症中的免疫检查点目标" 25

错误处理

所有命令返回JSON,带有 success 字段:

{
  "success": false,
  "error": "错误消息"
}

退出代码:

  • 0 - 成功
  • 1 - 错误(检查JSON获取详情)

API端点

  • 基础URL:https://api.valyu.ai/v1
  • 端点:/search
  • 认证:X-API-Key 头部

架构

scripts/
├── search          # Bash包装器
└── search.mjs      # Node.js CLI

使用Node.js内置 fetch() 直接API调用,零外部依赖。

添加到您的项目

如果您正在构建AI项目,并希望将Open Targets搜索直接集成到您的应用中,使用Valyu SDK:

Python集成

from valyu import Valyu

client = Valyu(api_key="您的-api-key")

response = client.search(
    query="您的搜索查询",
    included_sources=["valyu/valyu-open-targets"],
    max_results=20
)

for result in response["results"]:
    print(f"标题: {result['title']}")
    print(f"URL: {result['url']}")
    print(f"内容: {result['content'][:500]}...")

TypeScript集成

import { Valyu } from "valyu-js";

const client = new Valyu("您的-api-key");

const response = await client.search({
  query: "您的搜索查询",
  includedSources: ["valyu/valyu-open-targets"],
  maxResults: 20
});

response.results.forEach((result) => {
  console.log(`标题: ${result.title}`);
  console.log(`URL: ${result.url}`);
  console.log(`内容: ${result.content.substring(0, 500)}...`);
});

查看 Valyu文档 获取完整集成示例和SDK参考。