ChEMBL搜索

搜索完整的ChEMBL数据库，包括生物活性分子、药物靶点和结合数据，使用由Valyu语义搜索API支持的自然语言查询。

此技能的优势

无需API参数解析：直接传递自然语言查询，无需构建复杂的搜索参数
语义搜索：理解查询的含义，而非仅关键词匹配
全文访问：返回完整的化合物和靶点信息
图片链接：包括分子结构和数据可视化
全面覆盖：访问所有ChEMBL生物活性分子数据，用于药物发现

要求

Node.js 18+（使用内置fetch）
从https://platform.valyu.ai获取Valyu API密钥（$10免费积分）

关键：脚本路径解析

本文档中的scripts/search命令是相对于此技能的安装目录。

运行任何命令前，使用以下命令定位脚本：

CHEMBL_SCRIPT=$(find ~/.claude/plugins/cache -name "search" -path "*/chembl-search/*/scripts/*" -type f 2>/dev/null | head -1)

然后对所有命令使用完整路径：

$CHEMBL_SCRIPT "激酶抑制剂" 15

API密钥设置流程

当运行搜索并收到"setup_required": true时，遵循以下流程：

向用户询问API密钥： “要搜索ChEMBL，我需要您的Valyu API密钥。在https://platform.valyu.ai免费获取（$10积分）”
一旦用户提供密钥，运行：
```
scripts/search setup <api-key>
```
重试原始搜索。

使用场景

寻找药物发现的生物活性化合物
基于靶点的化合物搜索
化合物属性优化
测定数据和生物活性研究
结构-活性关系研究
先导化合物识别

输出格式

{
  "success": true,
  "type": "chembl_search",
  "query": "激酶抑制剂",
  "result_count": 10,
  "results": [
    {
      "title": "化合物/测定标题",
      "url": "https://chembl.org/...",
      "content": "化合物数据、靶点、测定结果...",
      "source": "chembl",
      "relevance_score": 0.95,
      "images": ["https://example.com/structure.png"]
    }
  ],
  "cost": 0.025
}

处理结果

使用jq

# 获取化合物标题
scripts/search "查询" 10 | jq -r '.results[].title'

# 获取URL
scripts/search "查询" 10 | jq -r '.results[].url'

# 提取完整内容
scripts/search "查询" 10 | jq -r '.results[].content'

常见用例

药物发现

# 寻找先导化合物
scripts/search "用于骨髓纤维化的JAK2选择性抑制剂" 50

靶点验证

# 搜索靶点信息
scripts/search "蛋白激酶B结合测定" 20

SAR分析

# 寻找结构-活性关系
scripts/search "苯并咪唑衍生物抗癌活性" 15

机制研究

# 搜索机制数据
scripts/search "NMDA受体的变构调节剂" 25

错误处理

所有命令返回带success字段的JSON：

{
  "success": false,
  "error": "错误信息"
}

退出代码：

0 - 成功
1 - 错误（检查JSON详情）

API端点

基础URL: https://api.valyu.ai/v1
端点: /search
认证: X-API-Key头部

架构

scripts/
├── search          # Bash包装器
└── search.mjs      # Node.js CLI

使用Node.js内置fetch()直接进行API调用，零外部依赖。

添加到您的项目

如果您正在构建AI项目并希望将ChEMBL搜索直接集成到应用程序中，请使用Valyu SDK：

Python集成

from valyu import Valyu

client = Valyu(api_key="您的API密钥")

response = client.search(
    query="您的搜索查询",
    included_sources=["valyu/valyu-chembl"],
    max_results=20
)

for result in response["results"]:
    print(f"标题: {result['title']}")
    print(f"URL: {result['url']}")
    print(f"内容: {result['content'][:500]}...")

TypeScript集成

import { Valyu } from "valyu-js";

const client = new Valyu("您的API密钥");

const response = await client.search({
  query: "您的搜索查询",
  includedSources: ["valyu/valyu-chembl"],
  maxResults: 20
});

response.results.forEach((result) => {
  console.log(`标题: ${result.title}`);
  console.log(`URL: ${result.url}`);
  console.log(`内容: ${result.content.substring(0, 500)}...`);
});

查看Valyu文档获取完整集成示例和SDK参考。