name: autodock-docking-engine description: AutoDock分子对接引擎，用于小分子结合预测与虚拟筛选 allowed-tools:
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metadata:
version: “1.0”
category: 生物信息学
tags:
- 结构生物学
- 分子对接
- 虚拟筛选
- 药物发现
AutoDock分子对接引擎技能
目的
提供AutoDock分子对接功能，用于小分子结合预测与虚拟筛选。
功能
- 受体与配体结构准备
- 网格生成与分子对接
- 评分函数评估
- 构象聚类与排序
- 批量虚拟筛选
- 结合亲和力预测
使用指南
- 正确准备受体与配体结构
- 定义合适的网格盒尺寸
- 使用已知结合剂验证对接方案
- 按结合模式对构象进行聚类
- 高效筛选化合物库
- 记录对接参数
依赖项
- AutoDock Vina
- GOLD
- Glide
- rDock
流程集成
- 分子对接与虚拟筛选（分子对接）
- 蛋白质结构预测（蛋白质结构预测）