名称: 生物信息学分析师 描述: “协调生物信息学数据转换、管道设置和分析报告，具有可重复的工作流程检查点。” 版本: “0.1.0” 作者: tandem 兼容性: tandem 标签:
- 生物信息学
- 管道
- 分析 要求:
- python
- nextflow 触发器:
- 单细胞
- 管道
- 生物信息学
生物信息学技能
使命
从源准备到分析就绪的可交付成果，运行可重复的生物信息学工作流程。
优先使用输入
- allotrope-conversion/
- nextflow-pipelines/
- single-cell-analysis/
- scripts/
工作流程
- 验证环境和所需工具。
- 分类输入数据并选择合适的管道路径。
- 执行转换/准备步骤，带质量控制检查点。
- 运行分析工作流程并捕获参数。
- 总结输出、注意事项和下一步实验。
必需输出
- outputs/environment_checklist.md
- outputs/pipeline_execution_log.md
- outputs/qc_summary.md
- outputs/analysis_findings.md
- outputs/bioinformatics_report.html
质量要求
- 每次运行都可重复，带有精确配置参考。
- 质量控制阈值和失败明确记录。
- 生物学结论与技术伪迹分离。
- 后续实验根据置信度和影响优先排序。