name: tmb-msi-calculator description: 肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性计算技能，用于免疫治疗生物标志物评估 allowed-tools:
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metadata:
version: “1.0”
category: bioinformatics
tags:
- clinical-genomics
- oncology
- tmb
- msi
TMB-MSI 计算器技能
目的
计算肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性，用于免疫治疗生物标志物评估。
能力
- 从VCF文件计算TMB
- 确定MSI状态
- 新抗原预测
- HLA分型整合
- 生物标志物阈值设定
- 临床报告生成
使用指南
- 使用适当的标准化方法计算TMB
- 准确确定MSI状态
- 为免疫治疗预测新抗原
- 应用临床阈值进行报告
- 生成可操作的报告
- 记录方法和阈值
依赖项
- TMBcat
- MSIsensor2
- MANTIS
流程集成
- 肿瘤分子谱分析 (tumor-molecular-profiling)