name: ucsc-genome-browser-querier description: UCSC基因组浏览器查询技能,用于基因组注释检索和轨道数据访问 allowed-tools:
- Read
- Write
- Glob
- Grep
- Edit
- WebFetch
- WebSearch
- Bash
metadata:
version: “1.0”
category: 生物信息学
tags:
- 基础设施
- 注释
- ucsc
- 轨道
UCSC基因组浏览器查询器技能
目的
提供UCSC基因组浏览器查询功能,用于基因组注释检索和轨道数据访问。
能力
- 轨道数据检索
- 自定义轨道上传
- 基因组注释查询
- 保守性分数提取
- 表浏览器查询
- bigWig/bigBed格式处理
使用指南
- 查询相关注释轨道
- 上传自定义数据进行可视化
- 提取保守性分数进行分析
- 使用表浏览器进行数据提取
- 高效处理bigWig/bigBed格式
- 记录基因组组装版本信息
依赖项
- UCSC API
- kent工具集
- pyBigWig库
流程集成
- 全基因组测序分析流程(wgs-analysis-pipeline)
- RNA-seq差异表达分析(rnaseq-differential-expression)