| 名称 | ucsc-genome-browser-querier |
| 描述 | UCSC基因组浏览器查询技能，用于基因组注释检索和轨道数据访问 allowed-tools: - Read - Write - Glob - Grep - Edit - WebFetch - WebSearch - Bash metadata: |
| 版本 | “1.0” category: 生物信息学 tags: - 基础设施 - 注释 - ucsc - 轨道 |
UCSC基因组浏览器查询器技能
目的
提供UCSC基因组浏览器查询功能，用于基因组注释检索和轨道数据访问。
能力
- 轨道数据检索
- 自定义轨道上传
- 基因组注释查询
- 保守性分数提取
- 表浏览器查询
- bigWig/bigBed格式处理
使用指南
- 查询相关注释轨道
- 上传自定义数据进行可视化
- 提取保守性分数进行分析
- 使用表浏览器进行数据提取
- 高效处理bigWig/bigBed格式
- 记录基因组组装版本信息
依赖项
- UCSC API
- kent工具集
- pyBigWig库
流程集成
- 全基因组测序分析流程（wgs-analysis-pipeline）
- RNA-seq差异表达分析（rnaseq-differential-expression）