LAMMPS分子动力学模拟器 lammps-md-simulator

这是一个用于原子尺度分子动力学模拟的专业技能。它专注于使用LAMMPS软件进行材料科学、化学和物理领域的仿真计算。核心功能包括:生成和验证LAMMPS输入脚本、为不同材料系统(如金属、半导体、聚合物)选择合适的力场(如EAM、Tersoff、ReaxFF)、配置模拟的边界条件和系统系综(NVT、NPT、NVE)、从模拟结果中提取和分析热力学性质(如温度、压力、能量)、处理和分析原子轨迹文件,以及优化大规模并行计算(MPI/GPU)的性能设置。该技能旨在帮助研究人员和工程师高效、准确地执行从纳米到微米尺度的材料行为模拟。 关键词:LAMMPS,分子动力学模拟,原子模拟,力场,并行计算,材料科学,热力学分析,轨迹分析,高性能计算,输入脚本

实验设计 0 次安装 0 次浏览 更新于 2/25/2026

name: lammps-md-simulator description: LAMMPS分子动力学模拟技能,用于原子尺度模拟、力场设置和大规模并行计算 allowed-tools:

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LAMMPS MD 模拟器

目的

提供关于LAMMPS分子动力学模拟的专家指导,包括输入脚本生成、力场选择和并行执行优化。

能力

  • 输入脚本生成与验证
  • 力场选择(EAM、Tersoff、ReaxFF)
  • 边界条件与系统系综配置
  • 热力学性质提取
  • 轨迹文件分析
  • 并行运行优化(MPI/GPU)

使用指南

  1. 输入脚本生成:创建语法和结构正确的LAMMPS输入文件
  2. 力场选择:为系统选择合适的原子间势函数
  3. 系统系综配置:正确设置NVT、NPT或NVE系综
  4. 输出分析:处理dump文件和热力学输出
  5. 性能优化:为高性能计算环境配置并行执行

工具/库

  • LAMMPS
  • OVITO
  • MDAnalysis