name: lammps-md-simulator description: LAMMPS分子动力学模拟技能,用于原子尺度模拟、力场设置和大规模并行计算 allowed-tools:
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- Grep metadata: specialization: 物理学 domain: 科学 category: 数值模拟 phase: 6
LAMMPS MD 模拟器
目的
提供关于LAMMPS分子动力学模拟的专家指导,包括输入脚本生成、力场选择和并行执行优化。
能力
- 输入脚本生成与验证
- 力场选择(EAM、Tersoff、ReaxFF)
- 边界条件与系统系综配置
- 热力学性质提取
- 轨迹文件分析
- 并行运行优化(MPI/GPU)
使用指南
- 输入脚本生成:创建语法和结构正确的LAMMPS输入文件
- 力场选择:为系统选择合适的原子间势函数
- 系统系综配置:正确设置NVT、NPT或NVE系综
- 输出分析:处理dump文件和热力学输出
- 性能优化:为高性能计算环境配置并行执行
工具/库
- LAMMPS
- OVITO
- MDAnalysis