名称: metaphlan-profiler 描述: 用于物种水平群落组成的MetaPhlAn宏基因组分析技能 允许使用的工具:
- 读取
- 写入
- 全局匹配
- 文本搜索
- 编辑
- 网络获取
- 网络搜索
- Bash
元数据:
版本: “1.0”
类别: 生物信息学
标签:
- 宏基因组学
- 物种分析
- 物种
- 群落
MetaPhlAn 分析技能
目的
实现MetaPhlAn宏基因组分析，用于物种水平的群落组成研究。
功能
- 特定分支标记基因分析
- 物种水平定量
- 菌株水平分析（StrainPhlAn）
- 未知物种估计
- 多样本热图生成
- 比较分析
使用指南
- 使用最新标记数据库
- 大多数分析在物种水平进行
- 相关时应用菌株水平分析
- 可视化群落组成
- 跨样本和条件比较
- 记录数据库版本
依赖项
- MetaPhlAn4
- StrainPhlAn
- mOTUs
流程集成
- 鸟枪法宏基因组学流程（shotgun-metagenomics）