name: pharmgkb-annotator description: PharmGKB 药物基因组学注释技能,用于药物-基因相互作用评估 allowed-tools:
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- WebSearch
- Bash
metadata:
version: “1.0”
category: bioinformatics
tags:
- 临床基因组学
- 药物基因组学
- 药物反应
- cpic
PharmGKB 注释器技能
目的
提供 PharmGKB 药物基因组学注释,用于药物-基因相互作用评估。
能力
- 星等位基因分型(Stargazer)
- 双倍型确定
- CPIC 指南整合
- 药物推荐生成
- 临床注释查询
- 剂量指导提取
使用指南
- 准确调用星等位基因
- 从基因型确定双倍型
- 应用 CPIC 指南进行剂量调整
- 生成可操作的建议
- 审查临床注释
- 记录指南版本
依赖项
- PharmGKB API
- Stargazer
- PharmCAT
流程集成
- 药物基因组学分析(pharmacogenomics-analysis)
- 临床变异解读(clinical-variant-interpretation)