name: alphafold-predictor description: 具备置信度评估和模型分析功能的AlphaFold蛋白质结构预测技能 allowed-tools:
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metadata:
version: “1.0”
category: 生物信息学
tags:
- 结构生物学
- 结构预测
- alphafold
- 蛋白质
AlphaFold预测器技能
目的
启用具备置信度评估和模型分析功能的AlphaFold蛋白质结构预测。
能力
- 结构预测执行
- pLDDT置信度评分
- PAE分析
- 多链复合物预测
- 基于模板的优化
- ColabFold集成
使用指南
- 查看pLDDT分数以评估预测置信度
- 分析PAE以确定结构域边界
- 预测多蛋白复合物的结构
- 存在同源物时使用模板
- 对照实验数据验证预测结果
- 记录模型版本和参数
依赖项
- AlphaFold2
- ColabFold
- RoseTTAFold
流程集成
- 蛋白质结构预测 (protein-structure-prediction)
- 分子对接与虚拟筛选 (molecular-docking)