name: humann-functional-profiler description: HUMAnN宏基因组功能分析技能,用于代谢通路分析 allowed-tools:
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metadata:
version: “1.0”
category: bioinformatics
tags:
- metagenomics
- functional
- pathway
- metabolism
HUMAnN功能分析技能
目的
为宏基因组通路分析提供HUMAnN功能分析。
功能
- 基因家族定量
- MetaCyc通路丰度分析
- UniRef注释
- 分层功能谱
- 通路覆盖度分析
- 自定义数据库集成
使用指南
- 首先运行分类学分析
- 定量基因家族和通路
- 相关时按生物体分层
- 分析通路覆盖度
- 比较功能谱
- 记录数据库版本
依赖项
- HUMAnN3
- eggNOG-mapper
- Prokka
流程集成
- 鸟枪法宏基因组测序流程 (shotgun-metagenomics)