name: maxquant-processor description: MaxQuant质谱分析技能，用于蛋白质鉴定和定量 allowed-tools:
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metadata:
version: “1.0”
category: bioinformatics
tags:
- proteomics
- mass-spectrometry
- quantification
- identification
MaxQuant 处理器技能
目的
提供MaxQuant质谱分析功能，用于蛋白质鉴定和定量。
能力
- 执行Andromeda搜索引擎
- 无标记定量（LFQ）
- TMT/iTRAQ标记定量
- 运行间匹配
- FDR控制和过滤
- PTM位点定位
使用指南
- 根据实验类型配置搜索参数
- 选择合适的定量方法
- 启用运行间匹配以改进定量
- 在蛋白质和肽段水平应用FDR过滤
- 准确定位PTM位点
- 记录数据库和参数版本
依赖项
- MaxQuant
- MSFragger
- Proteome Discoverer
流程集成
- 质谱蛋白质组学管道（ms-proteomics-pipeline）
- 多组学数据集成（multi-omics-integration）