生物医学搜索Skill biomedical-search

生物医学搜索技能用于跨多个生物医学数据库进行语义搜索,包括PubMed、bioRxiv、medRxiv、ClinicalTrials.gov和FDA药物标签。它支持自然语言查询,无需复杂参数设置,适用于临床研究、药物安全评估、治疗方案开发和医学写作等场景。关键词:生物医学搜索、语义搜索、临床研究、循证医学、文献检索、药物标签、临床试验。

文献检索 0 次安装 0 次浏览 更新于 3/18/2026

name: biomedical-search description: 结合PubMed、预印本、临床试验和FDA药物标签的完整生物医学信息搜索。由Valyu语义搜索API提供支持。 keywords:

  • biomedical-search
  • clinical-research
  • evidence-based-medicine
  • medical-research
  • comprehensive-search
  • semantic-search license: MIT

生物医学搜索

使用自然语言查询,通过Valyu语义搜索API,同时搜索所有主要生物医学数据库(PubMed、bioRxiv、medRxiv、ClinicalTrials.gov、FDA药物标签)。

为什么这个技能强大

  • 无需API参数解析:直接传递自然语言查询——无需构造复杂搜索参数
  • 语义搜索:理解查询含义,不仅仅是关键词匹配
  • 全文访问:从文献、试验和药物标签返回完整内容
  • 图像链接:包括可用的图表和图像
  • 全面覆盖:同时搜索PubMed、bioRxiv、medRxiv、临床试验和药物标签
  • 统一结果:在一个查询中获取所有生物医学来源的结果

要求

  1. Node.js 18+(使用内置fetch)
  2. https://platform.valyu.ai获取Valyu API密钥(10美元免费积分)

关键:脚本路径解析

本文档中的scripts/search命令相对于此技能的安装目录。

运行任何命令前,使用以下命令定位脚本:

BIOMEDICAL_SCRIPT=$(find ~/.claude/plugins/cache -name "search" -path "*/biomedical-search/*/scripts/*" -type f 2>/dev/null | head -1)

然后对所有命令使用完整路径:

$BIOMEDICAL_SCRIPT "CAR-T细胞疗法" 20

API密钥设置流程

当运行搜索并收到"setup_required": true时,遵循此流程:

  1. 向用户请求API密钥: “要搜索生物医学数据库,我需要您的Valyu API密钥。免费获取(10美元积分)请访问https://platform.valyu.ai

  2. 一旦用户提供密钥,运行

    scripts/search setup <api-key>
    
  3. 重试原始搜索

何时使用此技能

  • 完成生物医学信息收集
  • 结合基础科学的临床研究
  • 一起查找试验、文献和官方药物信息
  • 循证医学研究
  • 从多个角度理解疾病

输出格式

{
  "success": true,
  "type": "biomedical_search",
  "query": "CAR-T细胞疗法",
  "result_count": 20,
  "results": [
    {
      "title": "标题",
      "url": "https://...",
      "content": "完整内容...",
      "source": "pubmed|biorxiv|medrxiv|clinical-trials|drug-labels",
      "relevance_score": 0.95,
      "images": ["https://example.com/figure1.jpg"]
    }
  ],
  "cost": 0.035
}

处理结果

使用jq

# 获取标题
scripts/search "query" 20 | jq -r '.results[].title'

# 获取URL
scripts/search "query" 20 | jq -r '.results[].url'

# 提取完整内容
scripts/search "query" 20 | jq -r '.results[].content'

# 按来源类型筛选
scripts/search "query" 20 | jq -r '.results[] | select(.source == "clinical-trials") | .title'

常见用例

临床研究规划

# 为临床研究设计收集证据
scripts/search "黑色素瘤检查点抑制剂第二阶段试验" 50

药物安全评估

# 搜索文献、标签和试验获取安全数据
scripts/search "SGLT2抑制剂心血管安全性" 40

治疗方案开发

# 查找当前实践和新兴方法
scripts/search "pembrolizumab剂量方案NSCLC" 30

医学写作

# 医学传播的全面研究
scripts/search "JAK抑制剂类风湿关节炎疗效" 60

错误处理

所有命令返回带有success字段的JSON:

{
  "success": false,
  "error": "错误消息"
}

退出代码:

  • 0 - 成功
  • 1 - 错误(检查JSON以获取详情)

API端点

  • 基础URL:https://api.valyu.ai/v1
  • 端点:/search
  • 认证:X-API-Key头部

架构

scripts/
├── search          # Bash包装器
└── search.mjs      # Node.js CLI

使用Node.js内置fetch()进行直接API调用,零外部依赖。

添加到您的项目

如果您正在构建AI项目并希望将生物医学搜索直接集成到您的应用中,请使用Valyu SDK:

Python集成

from valyu import Valyu

client = Valyu(api_key="您的API密钥")

response = client.search(
    query="您的搜索查询",
    included_sources=["valyu/valyu-pubmed", "valyu/valyu-biorxiv", "valyu/valyu-medrxiv", "valyu/valyu-clinical-trials", "valyu/valyu-drug-labels"],
    max_results=20
)

for result in response["results"]:
    print(f"标题: {result['title']}")
    print(f"URL: {result['url']}")
    print(f"内容: {result['content'][:500]}...")

TypeScript集成

import { Valyu } from "valyu-js";

const client = new Valyu("您的API密钥");

const response = await client.search({
  query: "您的搜索查询",
  includedSources: ["valyu/valyu-pubmed", "valyu/valyu-biorxiv", "valyu/valyu-medrxiv", "valyu/valyu-clinical-trials", "valyu/valyu-drug-labels"],
  maxResults: 20
});

response.results.forEach((result) => {
  console.log(`标题: ${result.title}`);
  console.log(`URL: ${result.url}`);
  console.log(`内容: ${result.content.substring(0, 500)}...`);
});

查看Valyu文档获取完整集成示例和SDK参考。