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BLAST序列搜索技能Skill blast-sequence-search

BLAST序列搜索技能是一个生物信息学工具，专门用于执行序列相似性比对、同源性分析和生物数据库查询。该技能支持BLASTn、BLASTp、BLASTx等多种比对程序，能够创建和管理自定义数据库，并通过E值过滤和结果解析来优化搜索。适用于基因组学、蛋白质组学和宏基因组学研究，帮助科研人员快速识别序列间的进化关系和功能注释。 关键词：BLAST序列搜索，序列比对，同源性分析，生物信息学，数据库查询，NCBI BLAST，基因组学，蛋白质序列分析，宏基因组学

基因工程 1 次安装 22 次浏览 更新于 2/25/2026

name: blast-sequence-search description: 用于序列相似性搜索、同源性检测和数据库查询的BLAST技能 allowed-tools:

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  • Bash metadata: version: “1.0” category: bioinformatics tags:
    • sequence-analysis
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BLAST序列搜索技能

目的

提供BLAST功能，用于跨核苷酸和蛋白质序列进行序列相似性搜索、同源性检测和数据库查询。

能力

  • 执行BLASTn/BLASTp/BLASTx
  • 自定义数据库创建和管理
  • E值和比对过滤
  • 输出解析和结果注释
  • 批量查询处理
  • 远程NCBI数据库查询

使用指南

  • 根据查询/数据库类型选择适当的BLAST程序
  • 基于搜索灵敏度需求设置E值阈值
  • 为项目特定搜索创建自定义数据库
  • 解析和过滤结果用于下游分析
  • 考虑大型搜索的计算资源
  • 记录数据库版本以确保可重复性

依赖项

  • NCBI BLAST+
  • DIAMOND
  • MMseqs2

流程集成

  • 全基因组测序流程 (wgs-analysis-pipeline)
  • 蛋白质结构预测 (protein-structure-prediction)
  • 鸟枪法宏基因组学流程 (shotgun-metagenomics)