name: deseq2-differential-expression description: 使用DESeq2进行差异表达分析，包含标准化、统计建模和可视化功能 allowed-tools:
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metadata:
version: “1.0”
category: 生物信息学
tags:
- 转录组学
- 差异表达
- 统计学
- RNA测序
DESeq2差异表达分析技能
目的
提供基于DESeq2的差异表达分析，包含标准化、统计建模和可视化功能。
能力
- 大小因子标准化
- 负二项分布建模
- 收缩估计
- 批次效应建模
- 多因素实验设计
- 结果可视化（MA图、火山图等）
使用指南
- 设计具有适当重复的实验
- 存在批次效应时将其纳入模型
- 应用适当的收缩估计器
- 使用多重检验校正
- 生成出版级质量的可视化图表
- 记录分析参数和阈值
依赖项
- DESeq2
- edgeR
- limma-voom
流程整合
- RNA测序差异表达分析（rnaseq-differential-expression）
- 单细胞RNA测序分析（scrnaseq-analysis）
- CRISPR筛选分析（crispr-screen-analysis）