| 名称 | fusion-gene-detector |
| 描述 | 用于肿瘤学应用的多重检测器融合基因检测技能 allowed-tools: - Read - Write - Glob - Grep - Edit - WebFetch - WebSearch - Bash metadata: |
| 版本 | “1.0” category: bioinformatics tags: - clinical-genomics - oncology - fusions - rna-seq |
融合基因检测器技能
目的
为肿瘤学应用提供多重检测器集成的融合基因检测功能。
能力
- 基于RNA的融合基因检测
- 基于DNA的融合基因检测
- 多检测器共识分析
- 融合事件可视化
- 已知融合基因注释
- 临床可操作性评估
使用指南
- 使用多个检测器以提高灵敏度
- 从不同算法构建共识结果
- 使用已知融合基因数据库进行注释
- 可视化融合断点
- 评估临床可操作性
- 记录检测器组合
依赖项
- STAR-Fusion
- Arriba
- FusionCatcher
流程集成
- 肿瘤分子谱分析 (tumor-molecular-profiling)
- RNA-seq差异表达分析 (rnaseq-differential-expression)