| 名称 | ga4gh-standards-validator |
| 描述 | GA4GH 标准合规技能，用于数据共享和互操作性 allowed-tools: - Read - Write - Glob - Grep - Edit - WebFetch - WebSearch - Bash metadata: |
| 版本 | “1.0” category: bioinformatics tags: - infrastructure - standards - ga4gh - interoperability |
GA4GH 标准验证器技能
目的
为数据共享和互操作性提供 GA4GH 标准合规性支持。
能力
- VCF/BAM 格式验证
- htsget API 合规性检查
- Beacon 协议测试
- DRS/WES/TES 合规性检查
- 数据模型验证
- 互操作性测试
使用指南
- 根据规范验证文件格式
- 测试数据共享的 API 合规性
- 实现用于变异查询的 Beacon
- 确保工作流执行标准合规
- 验证用于交换的数据模型
- 记录合规状态
依赖项
- GA4GH 工具包
- htslib
- Beacon v2
流程集成
- 基因组数据治理 (genomic-data-governance)
- 可重复研究流程 (reproducible-research)