name: mageck-crispr-analyzer description: 用于基因必需性评分的MAGeCK CRISPR筛选分析技能 allowed-tools:
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metadata:
version: “1.0”
category: 生物信息学
tags:
- 专业
- crispr
- 筛选
- 必需性
MAGeCK CRISPR分析器技能
目的
提供MAGeCK CRISPR筛选分析，用于基因必需性评分。
能力
- 向导RNA计数
- 标准化与质量控制
- 基因水平分析
- 通路富集分析
- 复杂设计的MLE模型
- 可视化输出
使用指南
- 从测序数据中准确计数向导RNA
- 适当标准化计数
- 计算基因水平分数
- 进行生物通路富集分析
- 对复杂实验设计使用MLE方法
- 生成信息丰富的可视化结果
依赖项
- MAGeCK
- BAGEL
- CRISPResso2
流程集成
- CRISPR筛选分析 (crispr-screen-analysis)