生物制药 Skill技能列表

4.5

开放靶点数据库Skill opentargets-database

此技能用于通过开放靶点平台查询目标-疾病关联、药物靶点发现、可药性/安全性数据、遗传/组学证据等,以识别治疗靶点,支持药物研发和生物信息学分析。关键词包括:药物靶点、疾病关联、生物信息学、数据查询、靶点发现、药物重定位、可药性评估、安全性分析、遗传证据、组学数据、GraphQL API。

4.5

BoltzGen全原子蛋白质设计工具Skill boltzgen

BoltzGen是一款基于扩散模型的全原子蛋白质设计工具,专门用于生成具有精确侧链构象和结合几何结构的蛋白质。它支持蛋白质-蛋白质、蛋白质-小分子、抗体/纳米抗体CDR区以及环状肽的设计,适用于药物发现、酶工程和生物制剂开发等领域。关键词:蛋白质设计,全原子扩散,侧链建模,结合剂设计,AI生物计算,药物研发,结构预测,YAML配置,BoltzGen教程。

4.5

PyMOL分子可视化器Skill pymol-visualizer

PyMOL分子可视化技能是一款专注于生物分子结构渲染与分析的生物信息学工具。它能够实现蛋白质结构的三维可视化、表面渲染、结合位点高亮,并支持生成高质量的静态图像和动态动画,适用于科研绘图、药物发现和结构生物学分析。关键词:PyMOL,分子可视化,蛋白质结构,结构生物学,生物信息学,三维渲染,动画生成,科研绘图。

4.5

代谢组学工作台数据库技能Skill metabolomics-workbench-database

这个技能用于通过REST API访问NIH代谢组学工作台,查询代谢物、标准化命名、搜索质谱数据、获取研究元数据等,适用于代谢组学和生物标志物发现。关键词包括代谢组学、REST API、代谢物查询、质谱搜索、研究数据、生物标志物、数据分析。

4.5

Opentrons温度模块Skill opentrons-temperature-module

Opentrons温度模块技能用于在Opentrons自动化协议中实现精确温度控制,支持4-95°C范围的加热和冷却,适用于生物实验中的样本存储、酶反应和温度敏感协议。关键词:Opentrons、温度模块、实验室自动化、生物实验、温度控制、PCR、酶反应

4.5

蛋白质数据库访问工具Skill pdb

这是一个用于访问和操作RCSB蛋白质数据库(PDB)的专业工具。主要功能包括:蛋白质结构下载、PDB文件解析、链提取、结构域分析、界面残基识别、序列相似性搜索等。适用于生物信息学分析、药物设计、蛋白质工程和结构生物学研究。关键词:蛋白质结构,PDB数据库,生物信息学,结构分析,药物设计,RCSB API,蛋白质工程,生物分子建模。

4.5

ChEMBL数据库查询技能Skill chembl-database

这个技能用于程序化查询ChEMBL数据库,支持化合物搜索、生物活性数据检索、药物发现等功能,适用于药物研发、医学化学研究和数据分析。关键词:ChEMBL, 药物发现, 化合物, 生物活性, IC50, Ki, 医学化学, 数据查询。

4.5

吸光度板阅读器自动化技能Skill opentrons-absorbance-reader

这个技能用于在Opentrons Flex平台上自动化进行微板吸光度测量,支持单波长和多波长读取(450、562、600、650纳米),适用于ELISA、细胞生长监测、比色测定和动力学实验等生物医药应用。关键词:吸光度测量、自动化、ELISA、细胞密度、分光光度计、Opentrons Flex、生物实验、数据导出。

4.5

系统发育树构建器Skill phylogenetics-tree-builder

系统发育树构建器是一款专业的生物信息学分析工具,专门用于构建进化树和评估物种间的亲缘关系。该技能支持多序列比对(如MUSCLE、MAFFT)、最大似然树构建、贝叶斯推断、自举支持率计算、分子钟分析和进化树可视化。适用于微生物组分析、宏基因组学和全基因组测序等研究领域,帮助科研人员深入理解生物进化历程和物种分类关系。 关键词:系统发育树构建,进化树分析,多序列比对,最大似然树,贝叶斯推断,分子钟分析,生物信息学工具,亲缘关系评估,16S rRNA分析,宏基因组学

4.5

Seurat单细胞分析器Skill seurat-single-cell-analyzer

Seurat单细胞分析器是一款用于处理单细胞RNA测序数据的专业工具,主要功能包括数据质量过滤、标准化处理、降维分析(PCA/UMAP)、细胞聚类、标记基因识别、细胞类型自动注释、多数据集整合以及细胞发育轨迹推断。该技能适用于生物信息学研究人员进行单细胞转录组学分析、细胞异质性研究、发育生物学和疾病机制探索。关键词:单细胞RNA测序,Seurat分析,细胞聚类,生物信息学,转录组学,UMAP降维,细胞注释,轨迹分析,scRNA-seq

4.5

无细胞蛋白合成优化指南Skill cell-free-expression

本指南提供了无细胞蛋白合成(CFPS)的全面优化方案,涵盖系统选择、问题排查、密码子优化、模板设计、二硫键形成、可溶性增强等关键环节。适用于生物医药研发人员、合成生物学家、蛋白工程师进行体外蛋白表达实验设计、疑难蛋白表达优化和产量提升。关键词:无细胞蛋白合成,CFPS,蛋白表达优化,密码子优化,二硫键形成,可溶性标签,分子伴侣,体外翻译。

4.5

HMDB数据库技能Skill hmdb-database

本技能用于访问人类代谢组数据库,支持代谢物搜索、化学性质检索、生物标记物分析和代谢组学研究,关键词包括代谢组学、生物标记物、NMR光谱、数据科学、生物医药、科研学术。