生物制药 Skill技能列表
UniProt蛋白质数据库访问工具Skill uniprot
UniProt蛋白质数据库访问工具是一个专门用于检索蛋白质序列和注释信息的技能。通过UniProt REST API，用户可以快速获取蛋白质的FASTA序列、功能注释、结构域边界、同源蛋白、变异体信息，并能交叉引用PDB结构数据库。该工具支持通过登录号、基因名称等多种方式查询，适用于生物信息学分析、蛋白质工程、药物研发等领域。关键词：UniProt数据库，蛋白质序列，功能注释，结构域分析，PDB交叉引用，生物信息学工具，REST API访问
开放靶点数据库Skill opentargets-database
此技能用于通过开放靶点平台查询目标-疾病关联、药物靶点发现、可药性/安全性数据、遗传/组学证据等，以识别治疗靶点，支持药物研发和生物信息学分析。关键词包括：药物靶点、疾病关联、生物信息学、数据查询、靶点发现、药物重定位、可药性评估、安全性分析、遗传证据、组学数据、GraphQL API。
BoltzGen全原子蛋白质设计工具Skill boltzgen
BoltzGen是一款基于扩散模型的全原子蛋白质设计工具，专门用于生成具有精确侧链构象和结合几何结构的蛋白质。它支持蛋白质-蛋白质、蛋白质-小分子、抗体/纳米抗体CDR区以及环状肽的设计，适用于药物发现、酶工程和生物制剂开发等领域。关键词：蛋白质设计，全原子扩散，侧链建模，结合剂设计，AI生物计算，药物研发，结构预测，YAML配置，BoltzGen教程。
系统发育树构建器Skill phylogenetics-tree-builder
系统发育树构建器是一款专业的生物信息学分析工具，专门用于构建进化树和评估物种间的亲缘关系。该技能支持多序列比对（如MUSCLE、MAFFT）、最大似然树构建、贝叶斯推断、自举支持率计算、分子钟分析和进化树可视化。适用于微生物组分析、宏基因组学和全基因组测序等研究领域，帮助科研人员深入理解生物进化历程和物种分类关系。 关键词：系统发育树构建，进化树分析，多序列比对，最大似然树，贝叶斯推断，分子钟分析，生物信息学工具，亲缘关系评估，16S rRNA分析，宏基因组学
PyMOL分子可视化器Skill pymol-visualizer
PyMOL分子可视化技能是一款专注于生物分子结构渲染与分析的生物信息学工具。它能够实现蛋白质结构的三维可视化、表面渲染、结合位点高亮，并支持生成高质量的静态图像和动态动画，适用于科研绘图、药物发现和结构生物学分析。关键词：PyMOL，分子可视化，蛋白质结构，结构生物学，生物信息学，三维渲染，动画生成，科研绘图。
代谢组学工作台数据库技能Skill metabolomics-workbench-database
这个技能用于通过REST API访问NIH代谢组学工作台，查询代谢物、标准化命名、搜索质谱数据、获取研究元数据等，适用于代谢组学和生物标志物发现。关键词包括代谢组学、REST API、代谢物查询、质谱搜索、研究数据、生物标志物、数据分析。
Foldseek结构搜索Skill foldseek
Foldseek结构搜索技能是一个用于蛋白质三维结构相似性搜索与分析的生物信息学工具。它能够高效地在PDB、AlphaFold等大型结构数据库中，通过三维空间构象而非氨基酸序列，查找相似结构、进行结构比对、发现远缘同源物以及聚类分析。该工具对于蛋白质设计、功能注释、进化研究和药物发现等领域至关重要。关键词：Foldseek，结构相似性搜索，蛋白质结构，生物信息学，AlphaFold，PDB数据库，结构比对，同源建模。
DrugBank数据库访问技能Skill drugbank-database
此技能用于程序化访问和分析DrugBank数据库中的全面药物信息，包括药物属性、相互作用、靶点、化学结构等，适用于药物研发、药理学研究、药物相互作用分析、靶点识别、化学相似性搜索和ADMET预测。关键词：DrugBank数据库，药物信息，数据分析，药物研发，药理学，药物相互作用，靶点分析，化学属性。
HMDB数据库技能Skill hmdb-database
本技能用于访问人类代谢组数据库，支持代谢物搜索、化学性质检索、生物标记物分析和代谢组学研究，关键词包括代谢组学、生物标记物、NMR光谱、数据科学、生物医药、科研学术。
蛋白质数据库访问工具Skill pdb
这是一个用于访问和操作RCSB蛋白质数据库（PDB）的专业工具。主要功能包括：蛋白质结构下载、PDB文件解析、链提取、结构域分析、界面残基识别、序列相似性搜索等。适用于生物信息学分析、药物设计、蛋白质工程和结构生物学研究。关键词：蛋白质结构，PDB数据库，生物信息学，结构分析，药物设计，RCSB API，蛋白质工程，生物分子建模。
Seurat单细胞分析器Skill seurat-single-cell-analyzer
Seurat单细胞分析器是一款用于处理单细胞RNA测序数据的专业工具，主要功能包括数据质量过滤、标准化处理、降维分析（PCA/UMAP）、细胞聚类、标记基因识别、细胞类型自动注释、多数据集整合以及细胞发育轨迹推断。该技能适用于生物信息学研究人员进行单细胞转录组学分析、细胞异质性研究、发育生物学和疾病机制探索。关键词：单细胞RNA测序，Seurat分析，细胞聚类，生物信息学，转录组学，UMAP降维，细胞注释，轨迹分析，scRNA-seq
Opentrons温度模块Skill opentrons-temperature-module
Opentrons温度模块技能用于在Opentrons自动化协议中实现精确温度控制，支持4-95°C范围的加热和冷却，适用于生物实验中的样本存储、酶反应和温度敏感协议。关键词：Opentrons、温度模块、实验室自动化、生物实验、温度控制、PCR、酶反应