生物制药 Skill技能列表

4.5

Opentrons温度模块Skill opentrons-temperature-module

Opentrons温度模块技能用于在Opentrons自动化协议中实现精确温度控制,支持4-95°C范围的加热和冷却,适用于生物实验中的样本存储、酶反应和温度敏感协议。关键词:Opentrons、温度模块、实验室自动化、生物实验、温度控制、PCR、酶反应

4.5

吸光度板阅读器自动化技能Skill opentrons-absorbance-reader

这个技能用于在Opentrons Flex平台上自动化进行微板吸光度测量,支持单波长和多波长读取(450、562、600、650纳米),适用于ELISA、细胞生长监测、比色测定和动力学实验等生物医药应用。关键词:吸光度测量、自动化、ELISA、细胞密度、分光光度计、Opentrons Flex、生物实验、数据导出。

4.5

ChEMBL数据库查询技能Skill chembl-database

这个技能用于程序化查询ChEMBL数据库,支持化合物搜索、生物活性数据检索、药物发现等功能,适用于药物研发、医学化学研究和数据分析。关键词:ChEMBL, 药物发现, 化合物, 生物活性, IC50, Ki, 医学化学, 数据查询。

4.5

ChEMBL数据库查询技能Skill chembl-database

该技能提供对 ChEMBL 生物活性分子数据库的程序化访问,支持化合物搜索、生物活性数据检索(如 IC50、Ki)、药物发现研究和结构相似性分析,适用于药物化学、生物信息学和药物研发领域。关键词:ChEMBL 数据库、生物活性分子、药物发现、化合物搜索、生物活性数据、药物化学、生物信息学、药物研发。

4.5

Perseus统计分析器Skill perseus-statistical-analyzer

Perseus统计分析器是一款专业的蛋白质组学数据分析工具,专注于提供完整的统计分析和可视化解决方案。该技能支持缺失值填补、数据标准化、多种统计检验(如t检验、方差分析)、层次聚类、主成分分析(PCA)和富集分析,并能生成可直接用于发表的图表。它适用于生物信息学研究人员、蛋白质组学数据分析师,帮助处理质谱数据,进行差异表达分析和多组学数据整合。 关键词:蛋白质组学数据分析,Perseus统计,生物信息学工具,质谱数据处理,缺失值填补,数据标准化,统计检验,层次聚类,主成分分析,富集分析,数据可视化,发表级图表,多组学整合

4.5

Opentrons加热摇床模块Skill opentrons-heater-shaker

Opentrons加热摇床模块技能用于自动化实验室中的加热和摇床操作,提供精确的温度控制(37-95°C)和轨道混合(200-3000 rpm),适用于细胞培养、酶反应、细菌转化、ELISA洗涤等需要温度控制搅拌的协议。关键词:Opentrons、加热摇床、实验室自动化、细胞培养、酶反应、温度控制、摇床混合。

4.5

STRING网络分析器Skill string-network-analyzer

STRING网络分析器是一款生物信息学工具,专门用于蛋白质相互作用网络分析、功能富集分析和网络可视化。该技能支持从STRING数据库查询蛋白质相互作用关系,进行网络聚类识别功能模块,执行GO、KEGG等通路富集分析,并集成Cytoscape进行高质量网络可视化。适用于蛋白质组学研究、多组学数据整合和生物网络分析。关键词:蛋白质相互作用网络,功能富集分析,网络可视化,STRING数据库,生物信息学,蛋白质组学,Cytoscape,网络聚类

4.5

MaxQuant质谱分析处理器Skill maxquant-processor

MaxQuant质谱分析处理器是一款专业的生物信息学工具,专门用于蛋白质组学数据的处理和解析。该技能基于MaxQuant软件,集成了Andromeda搜索引擎,支持无标记定量(LFQ)和TMT/iTRAQ等标记定量技术,具备运行间匹配、假发现率(FDR)控制、翻译后修饰(PTM)位点定位等核心功能。适用于科研人员、生物技术公司和制药企业进行大规模蛋白质鉴定、定量分析和生物标志物发现。关键词:MaxQuant,质谱分析,蛋白质鉴定,蛋白质定量,生物信息学,蛋白质组学,LFQ,TMT,PTM,FDR控制。

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ipSAE结合剂设计排序工具Skill ipsae

ipSAE 是一个用于蛋白质-蛋白质相互作用预测结果排序的评分工具,专门针对结合剂设计优化。它能有效处理 AlphaFold2、AlphaFold3 和 Boltz1 等模型的输出,通过分析预测对齐误差来评估和排序设计的蛋白质结合剂,其精度优于传统的 ipTM 和 iPAE 评分方法。关键词:ipSAE,蛋白质设计,结合剂排序,AlphaFold,生物信息学,结构预测,蛋白质相互作用,评分函数