生物医药 Skill技能列表
IGV基因组浏览器技能Skill igv-genome-browser
IGV基因组浏览器技能是一个生物信息学工具，用于实现交互式基因组数据的可视化、分析和审阅。它支持加载和可视化BAM、VCF、BED等多种基因组数据格式，提供轨道定制、区域导航、多样本比较和批量截图等功能，并能与临床变异解读、肿瘤分析等流程集成，提升基因组数据审查的效率和可重复性。关键词：基因组浏览器，IGV，生物信息学，数据可视化，BAM，VCF，临床解读，肿瘤分析。
基因数据库查询Skill gene-database
该技能通过 NCBI E-utilities 和 Datasets API 查询 NCBI Gene 数据库，支持按基因符号或ID搜索，检索基因信息如参考序列（RefSeqs）、基因本体（GO）注释、位置和表型，进行批量查找，适用于基因注释、功能分析和生物信息学数据查询。关键词：基因查询、NCBI、生物信息、数据分析、数据库检索、基因本体、序列分析、批量处理。
UniProt蛋白质数据库访问工具Skill uniprot
UniProt蛋白质数据库访问工具是一个专门用于检索蛋白质序列和注释信息的技能。通过UniProt REST API，用户可以快速获取蛋白质的FASTA序列、功能注释、结构域边界、同源蛋白、变异体信息，并能交叉引用PDB结构数据库。该工具支持通过登录号、基因名称等多种方式查询，适用于生物信息学分析、蛋白质工程、药物研发等领域。关键词：UniProt数据库，蛋白质序列，功能注释，结构域分析，PDB交叉引用，生物信息学工具，REST API访问
开放靶点数据库Skill opentargets-database
此技能用于通过开放靶点平台查询目标-疾病关联、药物靶点发现、可药性/安全性数据、遗传/组学证据等，以识别治疗靶点，支持药物研发和生物信息学分析。关键词包括：药物靶点、疾病关联、生物信息学、数据查询、靶点发现、药物重定位、可药性评估、安全性分析、遗传证据、组学数据、GraphQL API。
BoltzGen全原子蛋白质设计工具Skill boltzgen
BoltzGen是一款基于扩散模型的全原子蛋白质设计工具，专门用于生成具有精确侧链构象和结合几何结构的蛋白质。它支持蛋白质-蛋白质、蛋白质-小分子、抗体/纳米抗体CDR区以及环状肽的设计，适用于药物发现、酶工程和生物制剂开发等领域。关键词：蛋白质设计，全原子扩散，侧链建模，结合剂设计，AI生物计算，药物研发，结构预测，YAML配置，BoltzGen教程。
蛋白质设计工作流Skill protein-design-workflow
本技能提供蛋白质设计的端到端流程指导，涵盖从靶标准备、骨架生成、序列设计到结构验证和筛选的完整工作流。适用于生物医药、合成生物学、药物研发等领域的蛋白质工程和设计项目。关键词：蛋白质设计、工作流、AI蛋白质设计、RFdiffusion、ProteinMPNN、AlphaFold、结构预测、生物信息学、计算生物学。
ACMG变异分类器Skill acmg-variant-classifier
ACMG变异分类器是一款基于ACMG/AMP临床指南的生物信息学工具，专门用于对基因变异进行系统性致病性评估。该技能能够自动化应用证据标准、整合群体频率数据与计算机预测结果、分析遗传模式，并生成标准化的分类报告。主要服务于临床遗传学、罕见病诊断和新生儿筛查等领域，帮助医生和研究人员快速、准确地解读基因变异的临床意义。 关键词：ACMG变异分类，致病性评估，临床遗传学，生物信息学，基因解读，罕见病诊断，变异分析，遗传咨询
CellRanger单细胞数据处理技能Skill cellranger-processor
CellRanger单细胞数据处理技能是专门用于处理10X Genomics单细胞测序数据的生物信息学工具。该技能能够实现BCL到FASTQ的格式转换、细胞条形码解复用、UMI计数、特征条形码处理、样本聚合分析以及生成Loupe可视化文件。适用于单细胞转录组学、空间转录组学等领域的研究人员，帮助高效完成数据预处理和初步分析。关键词：单细胞测序，10X Genomics，Cell Ranger，生物信息学，转录组学，数据解复用，UMI计数，空间转录组。
BLAST序列搜索技能Skill blast-sequence-search
BLAST序列搜索技能是一个生物信息学工具，专门用于执行序列相似性比对、同源性分析和生物数据库查询。该技能支持BLASTn、BLASTp、BLASTx等多种比对程序，能够创建和管理自定义数据库，并通过E值过滤和结果解析来优化搜索。适用于基因组学、蛋白质组学和宏基因组学研究，帮助科研人员快速识别序列间的进化关系和功能注释。 关键词：BLAST序列搜索，序列比对，同源性分析，生物信息学，数据库查询，NCBI BLAST，基因组学，蛋白质序列分析，宏基因组学
可溶性MPNNSkill solublempnn
SolubleMPNN是一种基于深度学习的蛋白质序列设计工具，专门用于优化蛋白质的可溶性表达。该技能通过训练模型预测和设计更易在大肠杆菌等系统中表达、减少聚集倾向的蛋白质序列。主要应用于生物医药研发、蛋白质工程、药物发现等领域，帮助研究人员解决蛋白质表达难题，提高实验成功率。关键词：蛋白质设计，可溶性优化，大肠杆菌表达，深度学习，生物信息学，序列设计，反向折叠，AI生物技术。
系统发育树构建器Skill phylogenetics-tree-builder
系统发育树构建器是一款专业的生物信息学分析工具，专门用于构建进化树和评估物种间的亲缘关系。该技能支持多序列比对（如MUSCLE、MAFFT）、最大似然树构建、贝叶斯推断、自举支持率计算、分子钟分析和进化树可视化。适用于微生物组分析、宏基因组学和全基因组测序等研究领域，帮助科研人员深入理解生物进化历程和物种分类关系。 关键词：系统发育树构建，进化树分析，多序列比对，最大似然树，贝叶斯推断，分子钟分析，生物信息学工具，亲缘关系评估，16S rRNA分析，宏基因组学
COSMIC癌症突变数据库访问技能Skill cosmic-database
这个技能用于通过编程方式访问COSMIC数据库，下载和分析癌症体细胞突变数据，包括突变、基因普查、签名等，支持癌症研究和精准肿瘤学。关键词：癌症突变、基因普查、签名分析、精准医疗、生物信息学、数据下载、癌症研究。