数据分析 Skill技能列表
COBRApy约束建模分析Skill cobrapy
COBRApy 是一个用于约束基重建与分析（COBRA）的 Python 库，专注于代谢模型的构建、模拟和优化。它支持通量平衡分析、通量可变性分析、基因敲除、通量采样、SBML模型处理等功能，广泛应用于系统生物学、代谢工程、药物研发和生物医学研究。关键词：约束建模、代谢分析、Python、系统生物学、代谢工程、通量平衡分析、基因敲除、生物信息学。
临床药物基因组学数据库技能Skill clinpgx-database
这个技能用于访问ClinPGx临床药物基因组学数据库，提供基因-药物交互查询、CPIC临床实践指南获取、等位基因功能数据检索等，支持精准医疗和基于基因型的剂量决策。关键词：临床药物基因组学、基因-药物交互、CPIC指南、等位基因、精准医疗、剂量决策。
临床试验数据库技能Skill clinicaltrials-database
这个技能用于通过API v2查询ClinicalTrials.gov数据库，支持按医疗条件、药物、地点、状态和阶段搜索临床试验，可检索详细试验信息并导出数据，适用于临床研究、数据分析、患者匹配和医疗决策。关键词：临床试验，数据查询，API，医疗研究，患者匹配，数据导出，临床数据分析。
细胞基因普查工具Skill cellxgene-census
这是一个专为查询和分析大规模单细胞基因表达数据设计的技能，提供对超过6100万细胞的标准化数据访问，支持跨组织、疾病和细胞类型的数据探索、机器学习模型训练，并集成扫描py、PyTorch等分析工具，关键词包括单细胞分析、基因表达、数据查询、机器学习、生物信息学。
BRENDA酶数据库访问技能Skill brenda-database
本技能通过SOAP API访问全球最全面的BRENDA酶数据库，用于检索酶的动力学参数（如Km、kcat）、反应方程、生物体数据和底物特异性信息，支持生化研究、代谢工程、酶发现和数据分析等应用。关键词包括酶数据库、动力学参数、数据检索、Python脚本、科研工具、生物信息学、代谢途径分析。
AnnData（注释数据矩阵技能）Skill anndata
AnnData是一个Python包，专用于处理带注释的数据矩阵，尤其适合单细胞RNA-seq分析，提供高效存储、操作和集成大规模数据集的能力。关键词：单细胞分析、注释数据矩阵、Python、数据科学、单细胞RNA-seq、数据存储、数据分析、生物信息学。
电子表格文件处理Skill xlsx
此技能专门用于处理电子表格文件，如 Excel、CSV、TSV 格式，涵盖打开、读取、编辑、修复、创建、转换和清理数据等任务。适用于数据分析、金融建模、数据可视化场景，使用工具如 LibreOffice、pandas、openpyxl 进行公式计算、格式化和专业输出。关键词：Excel、电子表格、数据处理、数据分析、金融模型、格式化、公式、pandas、openpyxl、LibreOffice、SEO 优化。
Jupyter笔记本编程操作Skill jupyter
这个技能用于编程式处理Jupyter笔记本文件，支持.ipynb文件的读取、修改、执行和格式转换，适用于数据科学和编程工作流，关键词包括Jupyter Notebook、数据科学、Python编程、自动化脚本、笔记本处理。
PDB数据库访问工具Skill pdb-database
这个技能用于访问RCSB PDB数据库，允许用户搜索和下载蛋白质和核酸的3D结构数据，包括文本、序列和结构相似性搜索，下载坐标文件（如PDB和mmCIF格式），检索元数据，适用于结构生物学研究、药物发现、生物信息学分析和科研数据工程。关键词：PDB数据库、3D结构、蛋白质结构、核酸结构、数据检索、结构生物学、药物发现、生物信息学、数据科学。
科学工作流管理Skill scientific-workflows
科学工作流管理技能帮助用户根据计算科学需求选择和实施合适的工作流工具，从轻量级的joblib缓存到复杂的Prefect、Parsl、FireWorks和quacc编排。适用于计算化学、机器学习、材料科学等科学计算场景，提供从简单脚本到生产级工作流的渐进增强方案。关键词包括科学工作流、工作流管理、计算科学、joblib、Prefect、Parsl、FireWorks、quacc、HPC、云原生。
PythonASE原子模拟技能Skill python-ase
本技能提供关于 Atomic Simulation Environment (ASE) Python 库的专家指导，用于原子模拟，包括结构构建、计算器设置、优化、动力学和分析等，适用于材料科学、化学模拟等领域。关键词：Python ASE, 原子模拟, 材料科学, DFT计算, 分子动力学, 结构优化, 模拟分析, ASE库
Pymatgen材料分析Skill pymatgen
Pymatgen是一个用于材料科学的Python库，用于晶体结构创建、分析、对称性检查、文件I/O、Materials Project API集成、相图构建和电子结构分析。它支持多种文件格式如CIF、POSCAR、XYZ，并可用于生成DFT计算输入。关键词：pymatgen, 材料科学, 晶体结构, 对称性分析, Python, 计算化学, 材料数据库。