数据分析 Skill技能列表
PyDESeq2基因差异表达分析Skill pydeseq2
PyDESeq2是一个用于批量RNA-seq数据差异基因表达分析的Python工具，基于DESeq2算法。它提供完整的分析工作流，包括数据加载、统计测试、FDR校正和可视化，适用于生物信息学研究和基因表达数据分析。关键词：差分基因表达分析，RNA-seq，DESeq2，Python，生物信息学，基因表达，数据分析。
PubChem数据库查询技能Skill pubchem-database
这个技能是一个化学信息学工具，用于通过 PubChem 数据库进行化合物查询、分子属性检索、相似性和子结构搜索、生物活性数据访问等，支持 Python API 集成，适用于药物研发、化学研究和数据科学应用。关键词：PubChem、化学数据库、化合物查询、分子属性、生物活性、化学信息学、药物发现、数据分析、Python。
OMERO集成Skill omero-integration
OMERO 集成技能是一个用于管理、可视化和分析显微镜图像数据的开源平台。通过Python API，用户可以访问图像、检索数据集、分析像素、管理ROI（兴趣区域）和注释，支持批处理和高内涵筛选工作流。关键词：显微镜数据管理，Python API，图像分析，ROI管理，批处理，高内涵筛选，科学数据平台。
神经像素分析Skill neuropixels-analysis
这个技能是一个综合工具包，用于分析Neuropixels高密度神经记录数据，采用SpikeInterface、Allen Institute和International Brain Laboratory的最佳实践。它支持从原始数据加载（SpikeGLX/OpenEphys格式）、预处理（如过滤和运动校正）、尖峰排序（如Kilosort4）、质量指标计算（信噪比、ISI违规）、AI辅助视觉分析和单元整理的完整工作流程。适用于神经科学、细胞外电生理学和数据分析研究。关键词：神经记录、尖峰排序、Neuropixels、数据分析、AI辅助分析、神经科学研究。
NeuroKit2神经信号处理工具包Skill neurokit2
NeuroKit2 是一个专为生理信号处理设计的 Python 工具包，支持心电图、脑电图、皮肤电活动等多种信号的分析，包括心率变异性、事件相关电位、复杂性测量等，广泛应用于科研和临床领域。关键词：生理信号处理、Python 工具包、生物信号分析、心率变异性分析、脑电图分析、皮肤电活动处理。
NetworkX网络分析库Skill networkx
NetworkX是一个Python库，专门用于创建、分析和可视化复杂网络和图表。它支持多种图类型、丰富的图算法、网络生成、文件I/O和可视化功能，适用于社交网络、生物网络、交通系统等领域。关键词：网络分析、图算法、Python库、数据可视化、复杂网络、社交网络分析、图数据处理、网络科学、算法库。
MATLAB/Octave数值计算技能Skill matlab
MATLAB和GNU Octave数值计算技能，用于矩阵运算、数据分析、可视化、科学计算、线性代数、信号处理、图像处理、微分方程、优化、统计等。关键词：MATLAB, Octave, 数值计算, 矩阵操作, 数据分析, 科学可视化, 信号处理, 优化, 统计。
质谱匹配与识别库Skill matchms
Matchms是一个开源的Python库，专用于质谱数据处理和分析，支持光谱相似性计算、化合物识别和代谢组学研究。关键词：质谱分析、光谱相似性、化合物识别、代谢组学、Python库。
KEGG数据库Skill kegg-database
这个技能提供对 KEGG（京都基因与基因组百科全书）数据库的 REST API 访问，支持通路分析、基因映射、代谢通路探索、药物相互作用检查和 ID 转换。适用于生物信息学研究、数据整合和科学分析。关键词：KEGG、通路分析、生物信息学、REST API、基因-通路映射、代谢通路、药物相互作用、数据集成。
GWAS目录数据库查询技能Skill gwas-database
GWAS目录数据库查询技能是一个用于查询遗传关联数据库的工具，允许用户通过rs ID、疾病性状、基因等搜索遗传变异体，检索p值、效应大小和统计摘要数据，适用于遗传流行病学研究、多基因风险评分构建、生物信息学分析和科研数据挖掘。关键词：GWAS、遗传关联、SNP查询、数据库、数据分析、生物信息、遗传流行病学、风险评分、统计摘要。
gget(生物信息学快速查询工具)Skill gget
gget是一个命令行和Python包，提供对20多个生物信息学数据库的统一访问，用于快速查询基因信息、序列分析、蛋白质结构、表达数据和疾病关联。它支持BLAST搜索、AlphaFold结构预测、富集分析等功能，适用于生物信息学研究、数据分析、基因组学探索。关键词：生物信息学、数据库查询、基因分析、序列比对、结构预测、富集分析、快速查询、Python工具。
GeoPandas空间分析库Skill geopandas
GeoPandas是一个Python库，用于处理和分析地理空间矢量数据，支持多种格式如Shapefile和GeoJSON，提供丰富的空间操作功能，包括缓冲区分析、空间连接、坐标变换等。适用于数据科学中的数据分析、可视化和地理信息系统（GIS）应用。