数据分析 Skill技能列表
PubChem数据库查询技能Skill pubchem-database
这个技能用于通过 PubChem 数据库查询化学化合物,支持名称、CID、SMILES 等多种标识符搜索,检索分子属性,进行相似性和子结构搜索,访问生物活性数据。适用于药物研发、化学信息学、科研数据分析等领域。关键词:PubChem, 化学数据库, 化合物查询, 分子属性, 相似性搜索, 子结构搜索, 生物活性, 药物发现, 数据检索, 科研工具。
PDB数据库访问工具Skill pdb-database
这个技能用于访问RCSB PDB数据库,允许用户搜索和下载蛋白质和核酸的3D结构数据,包括文本、序列和结构相似性搜索,下载坐标文件(如PDB和mmCIF格式),检索元数据,适用于结构生物学研究、药物发现、生物信息学分析和科研数据工程。关键词:PDB数据库、3D结构、蛋白质结构、核酸结构、数据检索、结构生物学、药物发现、生物信息学、数据科学。
HMDB数据库查询技能Skill hmdb-database
这个技能用于访问和查询人类代谢组数据库(HMDB),支持通过名称、ID、结构等方式搜索代谢物,检索化学性质、生物标志物数据、光谱信息等,适用于代谢组学研究、临床化学、生物标志物发现和代谢物鉴定。关键词:HMDB,代谢组学,代谢物数据库,生物信息学,数据分析,临床化学,生物标志物。
GWAS目录数据库查询Skill gwas-database
该技能用于查询NHGRI-EBI GWAS目录数据库,获取遗传变异与性状关联数据,支持遗传流行病学研究和风险评分模型构建。关键词:GWAS、数据库查询、SNP、性状关联、遗传学、数据分析。
GEO数据库访问技能Skill geo-database
这个技能用于访问NCBI GEO数据库,搜索和下载基因表达与基因组学数据,包括微阵列和RNA-seq数据集(如GSE、GSM、GPL),检索SOFT和Matrix文件,支持转录组学和表达分析。关键词:基因表达数据、NCBI GEO、转录组学、数据分析、生物信息学、GEO数据库。
FDA数据查询与分析工具Skill fda-database
该技能用于通过Python查询FDA的开放API,访问药物、医疗设备、食品、兽医产品等监管数据,支持安全研究、数据分析、药物警戒、趋势监控等应用。关键词包括FDA、数据查询、Python、药物安全、不良事件、召回跟踪、量化分析、监管合规。
ENA数据库Skill ena-database
这个技能用于通过REST API和FTP访问欧洲核苷酸存档(ENA),检索DNA/RNA序列、原始读段(FASTQ)、基因组组装和相关元数据,适用于基因组学和生物信息学管道。支持多种数据格式和高级搜索功能,方便数据集成和分析。关键词:基因组学,生物信息学,序列数据,API访问,数据检索,欧洲核苷酸存档。
临床试验数据库Skill clinicaltrials-database
这个技能用于通过ClinicalTrials.gov API v2查询和检索临床试验数据。它支持按医疗条件、干预药物、地理位置、研究状态或阶段进行搜索,可以获取详细试验信息并导出数据。适用于临床研究分析、患者匹配、药物开发跟踪、数据导出等场景。关键词:临床试验查询、API数据检索、临床研究工具、患者匹配系统、数据分析。
生物数据分析工具包Skill scikit-bio
scikit-bio 是一个用于生物信息学分析的 Python 工具包,提供序列处理、对齐、系统发育树构建、多样性计算、排序分析和统计测试等功能。关键词:生物数据、序列分析、系统发育树、多样性、PCoA、PERMANOVA、生物信息学、Python、数据分析。
神经信号处理工具包Skill neurokit2
NeuroKit2 是一个 Python 工具包,用于处理和分析生理信号如 ECG、EEG、EDA、RSP、PPG、EMG 和 EOG。它支持心变异性分析、事件相关电位、复杂度测量和自主神经系统评估,适用于心理生理学研究、临床应用和人机交互研究。关键词:生理信号处理、ECG分析、EEG分析、HRV、皮肤电反应、Python工具包、生物医学数据分析。
ETE工具包Skill etetoolkit
ETE工具包是一个用于系统发育树分析和可视化的Python库,支持树操作、进化事件检测、NCBI分类学集成、高质量图形输出和聚类分析,适用于生物信息学、进化生物学和数据科学研究。
DataCommons客户端Skill datacommons-client
Data Commons 客户端是一个 Python 库,用于访问 Data Commons 平台,提供程序化查询全球公共统计数据的功能,包括人口统计、经济指标、健康数据和环境统计等。适用于数据分析、量化金融、经济研究、学术探索和统计建模,关键词包括数据查询、API 集成、统计分析、公共数据访问、知识图谱和 Python 开发。