生物医药 Skill技能列表

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adaptyvSkill adaptyv

Adaptyv是一个云实验室平台,专注于自动化蛋白质测试和验证服务。它提供结合测定、表达测试、热稳定性测量和酶活性测定等多种实验类型,支持通过API提交实验、跟踪状态和下载结果。平台还包括蛋白质序列优化工具,如NetSolP、SolubleMPNN等,以提高表达和稳定性。适用于生物医药研究、蛋白质设计、高通量AI驱动工作流和CRO服务,关键词包括云实验室、蛋白质测试、自动化验证、API集成、生物医药、CRO、AI驱动。

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吸光度板阅读器自动化技能Skill opentrons-absorbance-reader

这个技能用于在Opentrons Flex平台上自动化进行微板吸光度测量,支持单波长和多波长读取(450、562、600、650纳米),适用于ELISA、细胞生长监测、比色测定和动力学实验等生物医药应用。关键词:吸光度测量、自动化、ELISA、细胞密度、分光光度计、Opentrons Flex、生物实验、数据导出。

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癌症突变数据库Skill cosmic-database

这个技能用于访问和下载COSMIC(癌症体细胞突变目录)数据库,提供癌症基因突变、癌症基因普查、突变签名、基因融合等数据,支持癌症研究、精准医疗和生物信息学分析。关键词:癌症突变、基因数据库、生物信息学、数据分析、精准医疗、癌症研究。

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AlphaFold蛋白质结构预测器Skill alphafold-predictor

AlphaFold蛋白质结构预测器是一款基于深度学习的生物信息学工具,专门用于预测蛋白质的三维空间结构。该技能整合了AlphaFold2、ColabFold和RoseTTAFold等先进模型,能够执行单链或多链复合物的高精度结构预测。核心功能包括生成预测模型、提供pLDDT置信度评分、进行预测对齐误差(PAE)分析以评估结构域可靠性,并支持基于已知同源模板的结构优化。适用于药物研发、蛋白质功能研究、合成生物学等领域,帮助科研人员快速获得可靠的蛋白质结构模型,加速生命科学发现。 关键词:AlphaFold,蛋白质结构预测,深度学习,生物信息学,pLDDT,PAE分析,多链复合物,ColabFold,结构生物学,AI药物发现

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ChEMBL数据库查询技能Skill chembl-database

该技能提供对 ChEMBL 生物活性分子数据库的程序化访问,支持化合物搜索、生物活性数据检索(如 IC50、Ki)、药物发现研究和结构相似性分析,适用于药物化学、生物信息学和药物研发领域。关键词:ChEMBL 数据库、生物活性分子、药物发现、化合物搜索、生物活性数据、药物化学、生物信息学、药物研发。

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基因组分析工具包GtarsSkill gtars

Gtars是一款基于Rust的高性能基因组分析工具包,提供Python绑定,专门用于基因组区间数据处理、BED文件操作、覆盖轨迹生成、重叠检测、机器学习令牌化和片段分析。适用于生物信息学、计算基因组学和机器学习应用,关键词包括基因组分析、Rust工具包、Python绑定、覆盖分析、令牌化、生物信息学。

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Perseus统计分析器Skill perseus-statistical-analyzer

Perseus统计分析器是一款专业的蛋白质组学数据分析工具,专注于提供完整的统计分析和可视化解决方案。该技能支持缺失值填补、数据标准化、多种统计检验(如t检验、方差分析)、层次聚类、主成分分析(PCA)和富集分析,并能生成可直接用于发表的图表。它适用于生物信息学研究人员、蛋白质组学数据分析师,帮助处理质谱数据,进行差异表达分析和多组学数据整合。 关键词:蛋白质组学数据分析,Perseus统计,生物信息学工具,质谱数据处理,缺失值填补,数据标准化,统计检验,层次聚类,主成分分析,富集分析,数据可视化,发表级图表,多组学整合

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DeepVariant变异检测器Skill deepvariant-caller

DeepVariant变异检测技能是一个基于深度学习的生物信息学工具,专门用于高精度检测基因组中的单核苷酸变异和插入缺失。该技能支持GPU加速、多种测序模式选择、模型定制化训练和容器化部署,适用于全基因组测序、外显子组测序和长读长测序数据分析。关键词:DeepVariant变异检测、深度学习基因组分析、SNV插入缺失检测、生物信息学工具、GPU加速测序分析、容器化生物信息流程。

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基因数据库查询技能Skill gene-database

NCBI基因数据库查询技能,用于通过E-utilities和Datasets API搜索基因信息,包括基因符号、ID、序列、功能注释、通路分析等,支持批量查询和基因注释,适用于生物信息学研究和功能分析。关键词:基因数据库,NCBI,API查询,基因信息,功能分析,生物信息学。

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ChEMBL数据库查询技能Skill chembl-database

这个技能用于程序化查询ChEMBL数据库,支持化合物搜索、生物活性数据检索、药物发现等功能,适用于药物研发、医学化学研究和数据分析。关键词:ChEMBL, 药物发现, 化合物, 生物活性, IC50, Ki, 医学化学, 数据查询。

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Opentrons加热摇床模块Skill opentrons-heater-shaker

Opentrons加热摇床模块技能用于自动化实验室中的加热和摇床操作,提供精确的温度控制(37-95°C)和轨道混合(200-3000 rpm),适用于细胞培养、酶反应、细菌转化、ELISA洗涤等需要温度控制搅拌的协议。关键词:Opentrons、加热摇床、实验室自动化、细胞培养、酶反应、温度控制、摇床混合。

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STRING网络分析器Skill string-network-analyzer

STRING网络分析器是一款生物信息学工具,专门用于蛋白质相互作用网络分析、功能富集分析和网络可视化。该技能支持从STRING数据库查询蛋白质相互作用关系,进行网络聚类识别功能模块,执行GO、KEGG等通路富集分析,并集成Cytoscape进行高质量网络可视化。适用于蛋白质组学研究、多组学数据整合和生物网络分析。关键词:蛋白质相互作用网络,功能富集分析,网络可视化,STRING数据库,生物信息学,蛋白质组学,Cytoscape,网络聚类