生物医药 Skill技能列表
ipSAE结合剂设计排序工具Skill ipsae
ipSAE 是一个用于蛋白质-蛋白质相互作用预测结果排序的评分工具，专门针对结合剂设计优化。它能有效处理 AlphaFold2、AlphaFold3 和 Boltz1 等模型的输出，通过分析预测对齐误差来评估和排序设计的蛋白质结合剂，其精度优于传统的 ipTM 和 iPAE 评分方法。关键词：ipSAE，蛋白质设计，结合剂排序，AlphaFold，生物信息学，结构预测，蛋白质相互作用，评分函数
ESM：进化规模建模Skill esm
ESM技能是一个基于深度学习的蛋白质语言模型工具包，用于蛋白质序列生成、结构预测、功能注释和嵌入生成。它支持ESM3和ESM C模型，适用于蛋白质设计、药物发现和生物工程应用，关键词：蛋白质语言模型，ESM，蛋白质设计，序列生成，结构预测，AI生成内容，生物医药。
三文鱼定量器Skill salmon-quantifier
Salmon定量分析技能是一个生物信息学工具，专门用于RNA测序数据的转录本定量分析。该技能采用先进的伪比对算法，能够快速准确地计算基因表达水平，支持GC偏差校正、多重比对解析和统计不确定性评估。主要应用于转录组学研究、差异基因表达分析和单细胞测序数据处理。 关键词：RNA测序定量，转录组分析，Salmon伪比对，基因表达计算，生物信息学工具，差异表达分析，单细胞RNA-seq，GC偏差校正，转录本丰度估计
Biopython工具包Skill biopython
Biopython是一个用于计算分子生物学的Python工具包，提供序列处理、文件解析、数据库访问、结构分析、系统发育学等功能，适用于生物信息学和科研数据分析。关键词：生物信息学、Python、序列分析、BLAST、NCBI、分子生物学、计算生物学、基因工程。
GA4GH标准验证器Skill ga4gh-standards-validator
GA4GH 标准验证器是一个用于确保基因组数据共享与互操作性的合规性检查工具。它专注于验证 VCF/BAM 等生物信息学文件格式、测试 htsget API 和 Beacon 协议、检查 DRS/WES/TES 工作流标准，并进行数据模型验证与互操作性测试。关键词：GA4GH 标准，数据共享，互操作性，基因组学，合规性验证，生物信息学工具，API 测试，数据模型。
生物服务Skill bioservices
BioServices 是一个统一的 Python 接口，用于访问 40 多个生物信息学服务，如 UniProt、KEGG、ChEMBL 等。它支持跨数据库分析、ID 映射、序列分析和多资源集成，适用于生物信息学研究和工作流自动化。关键词：生物信息学、Python、UniProt、KEGG、序列分析、标识符映射、数据库查询。
STRING数据库查询与分析技能Skill string-database
该技能用于通过STRING数据库的API进行蛋白质-蛋白质相互作用查询、网络分析、功能富集和系统生物学研究，涵盖关键词：蛋白质相互作用、STRING数据库、网络分析、功能富集、系统生物学、生物信息学。