生物医药 Skill技能列表
ESM:进化规模建模Skill esm
ESM技能是一个基于深度学习的蛋白质语言模型工具包,用于蛋白质序列生成、结构预测、功能注释和嵌入生成。它支持ESM3和ESM C模型,适用于蛋白质设计、药物发现和生物工程应用,关键词:蛋白质语言模型,ESM,蛋白质设计,序列生成,结构预测,AI生成内容,生物医药。
MAGeCKCRISPR分析器Skill mageck-crispr-analyzer
MAGeCK CRISPR分析器技能是一个专业的生物信息学工具,专门用于处理和分析CRISPR基因编辑筛选实验数据。该技能能够对向导RNA进行精确计数、数据标准化和质量控制,计算基因必需性评分,执行通路富集分析,并支持复杂实验设计的最大似然估计模型分析。适用于基因功能研究、药物靶点发现和癌症研究等领域。关键词:CRISPR筛选,基因必需性评分,生物信息学,MAGeCK,通路富集,基因编辑,高通量测序分析。
MEGAHIT宏基因组组装器Skill megahit-assembler
MEGAHIT宏基因组组装技能是一款专门用于从高通量测序产生的短读序列中重建微生物基因组的生物信息学工具。该技能支持内存高效组装、多种k-mer策略选择、重叠群质量评估和大数据集处理,适用于宏基因组学研究、微生物群落分析、环境样本测序数据分析等场景。关键词:宏基因组组装、MEGAHIT、基因组重建、短读序列、生物信息学、微生物基因组、重叠群分析、k-mer策略。
DrugBank数据库访问技能Skill drugbank-database
此技能用于程序化访问和分析DrugBank数据库中的全面药物信息,包括药物属性、相互作用、靶点、化学结构等,适用于药物研发、药理学研究、药物相互作用分析、靶点识别、化学相似性搜索和ADMET预测。关键词:DrugBank数据库,药物信息,数据分析,药物研发,药理学,药物相互作用,靶点分析,化学属性。
肿瘤突变负荷与微卫星不稳定性计算器Skill tmb-msi-calculator
该技能主要用于计算肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性,为免疫治疗提供关键生物标志物评估。通过分析基因测序数据,预测新抗原,整合HLA分型,并生成临床报告,帮助医生制定个性化免疫治疗方案。关键词:肿瘤突变负荷,微卫星不稳定性,免疫治疗,生物标志物,新抗原预测,临床基因组学,肿瘤学,TMB,MSI,精准医疗。
基因数据库查询技能Skill gene-database
NCBI基因数据库查询技能,用于通过E-utilities和Datasets API搜索基因信息,包括基因符号、ID、序列、功能注释、通路分析等,支持批量查询和基因注释,适用于生物信息学研究和功能分析。关键词:基因数据库,NCBI,API查询,基因信息,功能分析,生物信息学。
STRING数据库查询与分析技能Skill string-database
该技能用于通过STRING数据库的API进行蛋白质-蛋白质相互作用查询、网络分析、功能富集和系统生物学研究,涵盖关键词:蛋白质相互作用、STRING数据库、网络分析、功能富集、系统生物学、生物信息学。