生物医药 Skill技能列表
MetaPhlAn宏基因组分析器Skill metaphlan-profiler
MetaPhlAn宏基因组分析技能是一款专业的生物信息学工具，专门用于物种水平的微生物群落组成分析。该技能通过分析特定分支的标记基因，能够精确识别和量化宏基因组样本中的物种组成，支持菌株水平的深度分析（StrainPhlAn），并能估计未知物种的存在。它适用于多样本比较、群落组成可视化以及跨不同条件的对比研究，是微生物组研究、环境科学、临床诊断和生物技术领域的关键分析工具。
蛋白质设计质量控制Skill protein-qc
蛋白质设计质量控制技能，提供用于评估和筛选蛋白质设计的标准化指标、阈值与流程。它整合了结构置信度（pLDDT, pTM）、结合质量（ipTM, PAE）、表达可行性（不稳定指数, GRAVY）等多维度评估，并强调使用综合评分进行有效排序。该技能包含诊断工具和失败恢复指南，旨在帮助研究人员高效过滤不良设计，提升蛋白质设计项目的成功率。关键词：蛋白质设计，质量控制，筛选阈值，综合评分，生物信息学，AI蛋白质设计，结构预测，表达优化。
QIIME2微生物组分析器Skill qiime2-microbiome-analyzer
QIIME2 微生物组分析技能，专注于 16S rRNA 基因测序数据的处理与分析。核心功能包括：利用 DADA2 算法进行序列降噪和质量控制、对微生物群落进行物种分类学鉴定、计算 Alpha 和 Beta 多样性指标以评估群落结构与差异、进行差异丰度检验以识别关键物种，并支持系统发育分析。适用于肠道、环境、口腔等各类微生物组研究，是生物信息学和宏基因组学领域的关键分析工具。 关键词：QIIME2，微生物组分析，16S rRNA，宏基因组学，生物信息学，多样性分析，DADA2，物种分类，差异丰度
高级质量经理责任人(QMR)Skill quality-manager-qmr
高级质量经理责任人（QMR）技能专注于医疗科技和医疗设备公司的全面质量管理系统责任、监管合规监督、管理责任和战略质量领导。用于质量系统治理、监管合规监控、管理责任履行和质量战略规划，确保符合ISO 13485、FDA QSR等标准，提升组织质量卓越。关键词：质量经理、QMR、质量管理、监管合规、医疗器械、健康科技、ISO 13485、FDA、GMP合规、质量领导。
基因组数据分析工具Skill gget
gget 是一个命令行生物信息学工具和Python包，用于快速查询和分析基因组数据，提供对20多个数据库的统一访问，包括基因信息检索、序列对齐、蛋白结构预测、表达数据分析和疾病关联查询等功能。关键词：生物信息学、基因分析、序列对齐、蛋白预测、表达数据、疾病数据库、基因组工具、快速查询、统一接口、Python包。
Opentrons磁性块Skill opentrons-magnetic-block
Opentrons 磁性块技能用于自动化实验室中的磁珠分离工作流，支持DNA/RNA纯化、PCR清理、免疫沉淀等分子生物学实验。通过Opentrons Flex机器人的夹爪移动实验室器皿，结合高强度钕磁铁实现全自动化，适用于生物医药和科研领域。关键词：磁珠分离、DNA纯化、RNA提取、实验室自动化、Opentrons Flex、生物技术。
Opentrons温度模块Skill opentrons-temperature-module
Opentrons温度模块技能用于在Opentrons自动化协议中实现精确温度控制，支持4-95°C范围的加热和冷却，适用于生物实验中的样本存储、酶反应和温度敏感协议。关键词：Opentrons、温度模块、实验室自动化、生物实验、温度控制、PCR、酶反应
无细胞蛋白合成优化指南Skill cell-free-expression
本指南提供了无细胞蛋白合成（CFPS）的全面优化方案，涵盖系统选择、问题排查、密码子优化、模板设计、二硫键形成、可溶性增强等关键环节。适用于生物医药研发人员、合成生物学家、蛋白工程师进行体外蛋白表达实验设计、疑难蛋白表达优化和产量提升。关键词：无细胞蛋白合成，CFPS，蛋白表达优化，密码子优化，二硫键形成，可溶性标签，分子伴侣，体外翻译。
蛋白质设计工具环境初始化Skill setup
本技能用于指导用户完成蛋白质设计工具（如BoltzGen、RFdiffusion、Chai）的首次环境设置与配置。核心内容包括Modal CLI安装、身份验证、biomodals仓库克隆、GPU选择及常见问题排查。关键词：蛋白质设计，AI生物计算，环境配置，Modal云平台，BoltzGen，RFdiffusion，Chai，生物信息学工具。
Nextflow管道执行器Skill nextflow-pipeline-executor
Nextflow管道执行器是一个用于管理和执行生物信息学分析工作流的专业技能。它支持DSL2语法、容器化部署和云平台集成，确保分析流程的可重复性和可扩展性。关键词：Nextflow工作流、生物信息学管道、可重复研究、容器化、云执行、DSL2、nf-core、工作流管理。
配体感知蛋白质序列设计工具Skill ligandmpnn
LigandMPNN 是一个基于深度学习的蛋白质序列设计工具，专门用于在考虑配体（如小分子、金属离子、辅因子或核酸）存在的情况下，设计或优化蛋白质序列。它适用于酶活性位点设计、配体结合口袋优化、金属配位位点设计等生物医药和合成生物学场景。核心功能是进行配体感知的逆折叠，生成与特定配体高亲和力结合的蛋白质序列。关键词：蛋白质设计，配体感知，逆折叠，酶设计，结合口袋优化，LigandMPNN，AI蛋白质工程，生物计算。
adaptyvSkill adaptyv
Adaptyv是一个云实验室平台，专注于自动化蛋白质测试和验证服务。它提供结合测定、表达测试、热稳定性测量和酶活性测定等多种实验类型，支持通过API提交实验、跟踪状态和下载结果。平台还包括蛋白质序列优化工具，如NetSolP、SolubleMPNN等，以提高表达和稳定性。适用于生物医药研究、蛋白质设计、高通量AI驱动工作流和CRO服务，关键词包括云实验室、蛋白质测试、自动化验证、API集成、生物医药、CRO、AI驱动。