生物医药 Skill技能列表
蛋白质设计工作流Skill protein-design-workflow
本技能提供蛋白质设计的端到端流程指导，涵盖从靶标准备、骨架生成、序列设计到结构验证和筛选的完整工作流。适用于生物医药、合成生物学、药物研发等领域的蛋白质工程和设计项目。关键词：蛋白质设计、工作流、AI蛋白质设计、RFdiffusion、ProteinMPNN、AlphaFold、结构预测、生物信息学、计算生物学。
PyMOL分子可视化器Skill pymol-visualizer
PyMOL分子可视化技能是一款专注于生物分子结构渲染与分析的生物信息学工具。它能够实现蛋白质结构的三维可视化、表面渲染、结合位点高亮，并支持生成高质量的静态图像和动态动画，适用于科研绘图、药物发现和结构生物学分析。关键词：PyMOL，分子可视化，蛋白质结构，结构生物学，生物信息学，三维渲染，动画生成，科研绘图。
高级质量经理责任人(QMR)Skill quality-manager-qmr
高级质量经理责任人（QMR）技能专注于医疗科技和医疗设备公司的全面质量管理系统责任、监管合规监督、管理责任和战略质量领导。用于质量系统治理、监管合规监控、管理责任履行和质量战略规划，确保符合ISO 13485、FDA QSR等标准，提升组织质量卓越。关键词：质量经理、QMR、质量管理、监管合规、医疗器械、健康科技、ISO 13485、FDA、GMP合规、质量领导。
BWA比对器Skill bwa-aligner
BWA比对器技能是一个生物信息学工具，专门用于将高通量测序（NGS）产生的读段快速、准确地比对到参考基因组。它支持BWA-MEM2算法，具备参数优化、多线程加速、索引管理和质量评估等功能，适用于全基因组测序、长读段分析和肿瘤分子谱分析等场景。关键词：BWA-MEM2，序列比对，参考基因组，NGS分析，生物信息学，参数优化，质量评估。
蛋白质测试与验证云平台操作Skill adaptyv
这个技能涉及使用Adaptyv云实验室平台进行自动蛋白质测试和验证，包括结合测定、表达测试、热稳定性测量和酶活性测定。通过API或Web界面提交实验、跟踪状态、下载结果，并利用计算工具优化蛋白质序列以提高表达和稳定性。适用于生物医药领域的蛋白质设计、实验验证和高通量AI驱动工作流。关键词：蛋白质测试、云实验室、API自动化、实验验证、生物医药、蛋白质优化、合成生物学。
pysam基因组分析工具Skill pysam
pysam是一个用于处理基因组数据的Python工具包，支持读取和写入SAM/BAM/CRAM、VCF/BCF、FASTA/FASTQ文件，进行区域提取、覆盖率计算和生物信息学分析。适用于下一代测序（NGS）数据处理管道。关键词：pysam、基因组分析、生物信息学、Python、NGS、VCF、BAM、覆盖率计算、变异分析、序列处理。
HUMAnN功能分析器Skill humann-functional-profiler
HUMAnN功能分析器是一款用于宏基因组功能分析的专业技能，主要用于对微生物群落进行基因家族定量、代谢通路丰度分析、UniRef注释和分层功能谱分析。该技能支持MetaCyc通路数据库，能够评估通路覆盖度并集成自定义数据库，是宏基因组学研究中进行功能注释和代谢网络分析的核心工具。关键词：宏基因组分析、功能注释、代谢通路、基因家族定量、HUMAnN3、生物信息学、微生物群落、MetaCyc、UniRef、分层分析。
代谢组学工作台数据库技能Skill metabolomics-workbench-database
这个技能用于通过REST API访问NIH代谢组学工作台，查询代谢物、标准化命名、搜索质谱数据、获取研究元数据等，适用于代谢组学和生物标志物发现。关键词包括代谢组学、REST API、代谢物查询、质谱搜索、研究数据、生物标志物、数据分析。
ClinVar查询器Skill clinvar-querier
ClinVar查询器是一款专为生物信息学和临床基因组学设计的技能工具，主要用于从ClinVar数据库中查询和解读基因变异信息。该工具支持变异致病性查找、提交历史检索、疾病关联分析、证据等级评估、批量变异查询以及VCF文件注释集成等功能，是临床医生、遗传咨询师和研究人员进行遗传变异解读和罕见病诊断的重要辅助工具。关键词：ClinVar数据库、基因变异查询、致病性分析、临床基因组学、生物信息学工具、VCF注释、罕见病诊断、变异解读。
ACMG变异分类器Skill acmg-variant-classifier
ACMG变异分类器是一款基于ACMG/AMP临床指南的生物信息学工具，专门用于对基因变异进行系统性致病性评估。该技能能够自动化应用证据标准、整合群体频率数据与计算机预测结果、分析遗传模式，并生成标准化的分类报告。主要服务于临床遗传学、罕见病诊断和新生儿筛查等领域，帮助医生和研究人员快速、准确地解读基因变异的临床意义。 关键词：ACMG变异分类，致病性评估，临床遗传学，生物信息学，基因解读，罕见病诊断，变异分析，遗传咨询
Arboreto基因调控网络推断库Skill arboreto
Arboreto是一个用于从基因表达数据推断基因调控网络的工具库，支持GRNBoost2和GENIE3算法，适用于RNA-seq数据分析，包括单细胞和批量数据。关键词：基因调控网络、GRN、基因表达、转录组学、机器学习、GRNBoost2、GENIE3、分布式计算、生物信息学。
Latch生物信息工作流集成Skill latchbio-integration
LatchBio Integration是一个用于在云平台上构建、部署和管理生物信息学工作流的Python框架。它支持使用@workflow/@task装饰器定义任务，集成Nextflow和Snakemake管道，并提供数据管理、资源配置和已验证工作流功能，广泛应用于基因工程、RNA-seq分析、蛋白质结构预测等领域。关键词：生物信息学、工作流、Python、云平台、数据分析、基因工程、服务器无服务。